Bazy danych

Dane ultrasonograficzne w postaci surowych sygnałów radio-frequency (RF) zostały zarejestrowane dla zmian ogniskowych piersi u pacjentek Narodowy Instytut Onkologii w Warszawie w latach 2013–2015. Badania były wykonywane przez radiologa z 18-letnim doświadczeniem w diagnostyce ultrasonograficznej zmian piersi, co zapewnia wysoką jakość i wiarygodność zgromadzonych danych. Zbiór obejmuje łącznie 100 zmian ogniskowych zarejestrowanych u 78 pacjentek, w tym 52 zmiany złośliwe oraz 48 zmian łagodnych. Dla każdej zmiany wykonano dwa prostopadłe przekroje obejmujące obszar patologiczny, wykorzystując system badawczy Ultrasonix SonixTouch z liniową głowicą L14-5/38, co umożliwiło uzyskanie wysokorozdzielczych danych RF odpowiednich do zaawansowanej analizy ilościowej.
Walidacja kliniczna została przeprowadzona w oparciu o standardy diagnostyczne obowiązujące w praktyce klinicznej. Wszystkie zmiany złośliwe zostały potwierdzone histopatologicznie na podstawie biopsji gruboigłowej, natomiast w przypadku zmian łagodnych część została potwierdzona histopatologicznie, a pozostałe były monitorowane w obserwacji klinicznej przez okres dwóch lat, co pozwoliło na wiarygodną klasyfikację charakteru zmian.

Zgromadzone dane zostały zapisane w formacie MATLAB (.mat) i obejmują zarówno surowe sygnały RF dla każdego skanu, jak i zdefiniowane obszary zainteresowania (ROI), umożliwiające precyzyjne wskazanie regionu zmiany. Dodatkowo dla każdej zmiany dostępne są informacje o kategorii BI-RADS oraz klasyfikacji zmiany jako łagodnej lub złośliwej. W celu ułatwienia pracy z danymi udostępniono również przykładowe skrypty demonstrujące ich przetwarzanie i analizę.

Baza danych jest publicznie dostępna i może być pobrana z repozytorium Zenodo (https://doi.org/10.5281/zenodo.54592) <> lub ze strony projektu http://bluebox.ippt.gov.pl/~hpiotrzk. Stanowi ona wartościowe źródło danych dla badań nad ilościową ultrasonografią, rozwojem metod analizy obrazów oraz tworzeniem systemów wspomagania decyzji klinicznych. Może być również wykorzystywana w badaniach nad zastosowaniem sztucznej inteligencji i radiomiki w diagnostyce raka piersi, szczególnie w kontekście analizy surowych sygnałów RF, które zawierają więcej informacji niż standardowe obrazy B-mode.

Więcej informacji: Open access database of raw ultrasonic signals acquired from malignant and benign breast lesions, Hanna Piotrzkowska-Wróblewska, Katarzyna Dobruch-Sobczak, Michał Byra, Andrzej Nowicki